Systembiologie

2005 bis Juli 2007 arbeitete ich als Doktorand am Hans-Knöll-Institut für Naturstoff-Forschung und Infektionsbiologie (HKI), Jena, in einem Kooperationsprojekt zu Ursachen und Therapie von rheumatoider Arthritis. Ziel ist der systematische Aufbau und die Validierung einer Wissensbasis zur Dynamik der Genregulation. Erste Ergebnisse enthält der folgende Beitrag zur ICFCA'07 (International Conference on Formal Concept Analysis), Clermont-Ferrand, 12.-17.2.2007:

Attribute Exploration of Discrete Temporal Transitions

Anwendung von Begriffshierarchien und Merkmalexploration zur Strukturierung einer Naturstoff-Datenbank sowie auf genregulatorische Netze bei Bacillus subtilis und im Zusammenhang mit menschlicher rheumatoider Arthritis:

Vortrag am HKI Jena vom 24.5.2007

Die Doktorarbeit soll Ende 2008 abgeschlossen sein; die Methoden sind vielfältig anwendbar.

An Artikel für "Algebraic Biology 2008", Hagenberg, Austria:

Constructing a Knowledge Base for Gene Regulatory Dynamics by Formal Concept Analysis Methods


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